صفحه PCR رنگی می تواند به عنوان DNA استریل بدون RNA استفاده شود

رنگ PCR (کاهش مکمل رنگ) به معنای واقعی کلمه به عنوان"؛ تشخیص مکمل رنگ"؛ ترجمه می شود که نوعی LP-PCR است. رنگ PCR ترجمه واضح تری دارد: از رنگ فلورسنت برای برچسب زدن انتهای پرایمر 5' استفاده می کند. رنگهای فلورسنت JOE و FAM فلورسانس سبز هستند. TAMRA فلورسانس قرمز است. COUM فلورسانس آبی است. پرایمرهای مختلف نشاندار شده با فلورسنت به طور همزمان در واکنش شرکت می کنند و ژن هدف تقویت شده رنگ را در انتهای پرایمر 5' خواهد داشت. از طریق الکتروفورز یا رسوب گریز از مرکز، چشم غیرمسلح می تواند با توجه به رنگ فلورسانس های مختلف، درباره وجود ژن هدف و نوع ژن تقویت شده قضاوت کند. . معمولاً فقط دو پرایمر با رنگ های مختلف مورد نیاز است، یکی به عنوان پرایمر تشخیص ژن استفاده می شود. دیگری به عنوان یک کنترل داخلی برای کنترل شرایط برای تشخیص حذف ژن، جابجایی کروموزومی یا عفونت با یک ویروس خاص استفاده می شود. هنگام تشخیص جهش های چند نقطه ای، می توان از رنگ های بیشتری استفاده کرد. به عنوان مثال، بیماری‌های ژنتیکی با جهش‌های چند نقطه‌ای، چندین عفونت ویروسی مشکوک، و آنالیز محل HLA می‌توانند از PCR رنگی برای شناسایی چندین محل به طور همزمان استفاده کنند.